Phạm vi kiểm tra:Phạm vi diệp lục: 0,0‐99,9 SPADNitơ: 0,0‐99,9mg / g
Độ ẩm lá: 0,0‐99,9RH%Nhiệt độ lá: ‐10‐99,9 ° CKiểm tra chủng loại với kích thước: 2mm * 2mm
Khoảng thời hạn thử nghiệm: dưới 3 giây
Máy Phân Tích dinh dưỡng Thực Vật núm Tay
(nitơ, diệp lục, ánh nắng mặt trời lá và độ ẩm lá)
Model: TPC-4N
Hãng sản xuất: Taisitelab
Xuất xứ: Trung Quốc
Bảo hành 12 tháng,Cung cấp bao gồm chứng chỉ CO,CQ và bệnh từ hàng hóa nhập khẩu
Mô tả sản phẩm:
Máy phân tích dinh dưỡng thực vật còn gọi là thiết bị chẩn đoán bồi bổ cây trồng, hoàn toàn có thể đo bốn thông số kỹ thuật (chất diệp lục, các chất nitơ, ánh sáng lá và nhiệt độ lá) cùng một lúc. Để giải quyết và xử lý nhu mong nitro thực sự của cây cùng hiểu mức độ của đất thiếu nitro hoặc bón quá nhiều phân đạm. Trải qua hướng dẫn của sản phẩm kiểm tra dinh dưỡng cây cối TYS-4N có thể tăng xác suất sử dụng phân đạm và bảo đảm an toàn môi trường. Vật dụng phân tích bổ dưỡng thực vật hoàn toàn có thể được sử dụng rộng thoải mái trong các cơ sở nghiên cứu và phân tích khoa học liên quan đến nông lâm nghiệp và các trường đh để nghiên cứu và phân tích các chỉ tiêu sinh lý thực vật cùng hướng dẫn sản xuất nông nghiệp.Bạn đang xem: Phân tích dữ liệu thực vật
Đặc điểm:
1. Chất vấn nhanh chóng, không ảnh hưởng đến sự phát triển của cây.
2. Toàn bộ các thông số hoàn toàn có thể được đo cùng một lúc với hiển thị trong thời gian thực.
3. Bốn thông số kỹ thuật (nitơ, diệp lục, ánh sáng lá và độ ẩm lá) được hiển thị trên màn hình hiển thị và có thể được tàng trữ cùng lúc. Quý giá trung bình của tư chỉ mục rất có thể được tính toán tự động.
4. Giao diện gồm “cài để hệ thống”, “xem dữ liệu”, “cài đặt tiết kiệm chi phí năng lượng”, “cài đặt đồng hồ”, “xóa dữ liệu” cùng các công dụng khác.
5. Xem tài liệu lịch sử, tuần từ bỏ hoặc nhảy đầm vị trí.
6. Lượng phân bón tiêu chuẩn chỉnh có thể được tính trực tiếp bằng phương pháp nhập tên cây trồng, lượng chất nitơ tiêu chuẩn và tỷ lệ sử dụng.
7. Dữ liệu đã được lưu trong đồ vật chủkhông bị mấtsau khi mất điện bỗng xuất.
8. Tài liệu lịch sử có thể được xóa riêng lẻ hoặc bởi một cú nhấp chuột.
9. Thiết bị tất cả giao diện USB riêng, rất có thể kết nối máy tính xách tay để xuất dữ liệu đo được. Nó là thuận lợi cho việc thống trị và phân tích những chất dinh dưỡng thực vật.
10. Tích hợp bộ nguồn sạc pin lithium, pin sạc trực tiếp không buộc phải thay pin, sản phẩm có công dụng đèn nền riêng.
Thông số kỹ thuật:
Các yếu tắc kiểm tra: Nitơ, Diệp lục, ánh sáng lá, Độ ẩm lá
Phạm vi kiểm tra:
Phạm vi diệp lục: 0,0‐99,9 SPADNitơ: 0,0‐99,9mg / gĐộ ẩm lá: 0,0‐99,9RH%Nhiệt độ lá: ‐10‐99,9 ° CKiểm tra chủng loại với kích thước: 2mm * 2mm
Khoảng thời hạn thử nghiệm: bên dưới 3 giây
Dung lượng dữ liệu đã lưu lại trữ: 32KBNguồn cung cấp: 4.2V 2000mah pin sạc lại sạc Li ‐ ion
Độ chính xác kiểm tra:
Độ đúng mực của chấtDiệp lục: ± 3SPADĐộ đúng mực của nitơ: ± 5%Độ đúng đắn về nhiệt độ của lá: ± 0.5%Độ đúng đắn về nhiệt độ của lá: ± 0.5 ° C
-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
Đại diện nhập khẩu và bày bán Thiết Bị Nông Lâm NghiệphãngTaisite
Labtại Việt Nam
Error message
Deprecated function: The each() function is deprecated. This message will be suppressed on further calls in _menu_load_objects() (line 579 of /home/chuyenbentre.edu.vn/GIT/vjs/main_website/includes/menu.inc).
Nguyễn V. Cường1
1Khoa Di truyền chọn giống cây trồng, Đại học Cornell, Bang New York, Hoa Kỳ.
22Department of Cancer Biology, the University of Texas M.D. Anderson Cancer Center, Houston, TX, USA 77054.
Biên tập viên: hương thơm Hà, Stanford University, Stanford, California, USA
* Mọi vướng mắc về nội dung bài viết xin tương tác email cvn6
cornell.edu
Tóm tắt: Ở cây trồng, những tính trạng nông học đặc biệt quan trọng như năng suất thường là những tính trạng con số chịu ảnh hưởng của các gene không giống nhau và ảnh hưởng của môi trường. Đối với những tính trạng này việc xác minh các locus điều khiển tính trạng (Quantitative Trait Locus-QTL- mapping) được dựa vào việc phân tích kiểu gene với kiểu hình ở những quần thể phân li cùng áp dụng những công nỗ lực thống kê độc nhất định.Bài so với này reviews sơ qua một cách thức QTL mapping cơ bản thông qua một phân tích về năng suất lúa.
Abstract: In crop plants, important agronomical traits lượt thích yield are quantitative traits influenced by many genes và by the environment.Theidentification of quantitative trait loci (QTL mapping) for these traits is based on analyzing genotypes & phenotypes in segregating populations và applying appropriate statistical tests. This article briefly introduces a basic QTL mapping method applied in a study of rice yield.
Từ khoá: so sánh QTL | chỉ thị phân tử | bóc tách dòng gen | năng suất.
Giới thiệu
Sinh học tập thực vật là một ngành kỹ thuật dựa những vào các cách thức và kỹ thuật và vấn đề nắm vững chắc các cách thức và nghệ thuật này để giúp đỡ nghiên cứu được nhiều vấn đề rõ ràng khác nhau.Trong bài xích tóm lược này tôi ko định tổng hòa hợp các kết quả nghiên cứu mà mong mỏi mượn một bài báo xuất dung nhan (1) để giới thiệu sơ qua một cách thức phân tích tính trạng con số ở thực vật.
Ashihaki et al (1) điều tra sự khác biệt về năng suất làm việc hai như là lúa và bằng bài toán phân tích hình dáng hình cùng kiểu gen của quần thể tạo thành từ hai giống này đã tìm ra được đúng chuẩn những gene liên quan đến năng suất, trong số những tính trạng đặc biệt nhất sinh sống cây trồng.
Năng suất là 1 trong tính trạng con số phức tạp.Về cơ phiên bản nó là tổng hợp của không ít tính trạng khác nhau. Năng suất có thông số di truyền thấp, tác động lớn bởi những yếu tố môi trường. Năng suất được tính là số tấn/hecta. Ở cây ngũ cốc hạt bé dại như lúa, năng suất có thể được tính là tích số giữa số lượng hạt lúa trên cây và trọng lượng hạt. Năng suất là một trong những đặc tính mang tính chất quần thể vị trong thực tế sản xuất tính trạng này luôn được đối chiếu trên một diện tích s sản xuất với hàng trăm ngàn cây chứ không chỉ trên một thành viên đơn lẻ, song nghiên cứu và phân tích trên quy mô bé dại sẽ là bước mở đầu để khảo sát đại trà trên diện tích s lớn hơn. Để tăng năng suất, các nghiên cứu thường triệu tập vào tăng con số hạt lúa bên trên một bông cùng số bông bên trên cây. Đây hồ hết là những đại lượng có thể đo đếm được một cách chủ yếu xác, một điều kiện hết sức quan trọng đặc biệt trong phân tích di truyền số lượng, vị nếu không tồn tại được cách thức xác định đúng mực kiểu hình tính trạng cần nghiên cứu thì dù có áp dụng những kĩ thuật đối chiếu phân tử cùng thống kê sau này, công dụng tìm ra cũng biến thành không phản ánh đúng bản chất di truyền của tính trạng.
Phương pháp xác định locus tính trạng số lượng
Như nhắc ở trên, năng suất là 1 trong tính trạng số lượng, sự biệt lập về năng suất chưa hẳn do sự phân li của một hoặc hai ren mà là vì sự phân li của nhiều gene, với tác động của mỗi ren là nhỏ. Tính trạng con số không phân li thành những nhóm rõ ràng do kia ta không thể dễ dàng chỉ sử dụng những nguyên lí dt Mendel nhằm nghiên cứu. Cụ vào đó, phương án cho phân tích các tính trạng này là xác xác định trí các locus của tính trạng con số dựa trên sự liên kết với marker phân tử (QTL mapping). Ở thực vật, tất cả hai cách thức chính vào QTL mapping: 1) Sử dụng các quần thể tạo nên từ các phép lai được điều hành và kiểm soát (ví dụ như quần thể F2, quần thể lai trở lại...) 2) Sử dụng các quần thể trường đoản cú nhiên, giao phấn tự do không điều hành và kiểm soát (phương pháp này nói một cách khác là lập bạn dạng đồ phối hợp - association mapping). Phương pháp 1) cân xứng cho các loài tất cả vòng đời ngắn, dễ dàng lai tạo thành và tạo nhiều hạt ở vắt hệ sau, đồng thời bao gồm phương thức tính toán đơn giản và dễ dàng hơn. Cách thức 2) hữu ích thế là không phải tạo ra quần thể phân li, phù hợp cho các loài giao phấn, vòng đời dài và rất có thể phân tích được rất nhiều allele và một lúc. Mặc dù vậy phương thức 2) có rất nhiều yếu tố tạo nhiễu vì sự giao phấn và tinh lọc không được kiểm soát và phép thống kê tinh vi hơn. Ở đây, Ashihaki et al (1) sử dụng phương pháp 1) với quần thể được tạo nên từ phép lai hai tía mẹ.Việc đối chiếu thống kê đẳng cấp gene với kiểu hình của những cá thể nghỉ ngơi quần thể phân li để giúp tìm ra những vùng trên nhiễm sắc thể hoàn toàn có thể có liên quan với tính trạng phải nghiên cứu. Kết quả thống kê cũng cho thấy thêm được sự tác động mạnh tuyệt yếu của vùng nhiễm dung nhan thể kia với tính trạng để sở hữu các nghiên cứu tiếp theo. Các yêu ước cho QTL mapping từ những quần thể lai có kiểm soát được liệt kê nghỉ ngơi bảng bên. Hiện tại nay, những kỹ thuật xác minh kiểu gene với giải trình tự gấp rút đã giúp cho việc lập bản đồ phân tử và xác định kiểu gene các cá thể thuận lợi hơn.
Các yêu cầu cho QTL mapping từ những quần thể lai gồm kiểm soát
Có những marker phân tử (trung hòa, đồng trội)
Có phiên bản đồ di truyền liên kết phân tử
Các quần thể có sự “mất cân đối liên kết” (linkage disequilibrium - LD). LD có thể được phát âm một cách dễ dàng và đơn giản là lúc biết kiểu gen của một locus có thể suy ra được thứ hạng gene của locus khác - hay là do nằm bên cạnh nhau trên nhiễm dung nhan thể
Có phương pháp đo lường vẻ bên ngoài hình tính trạng tin cậy
Có cách thức thống kê /phần mềm để xác minh sự link giữa marker cùng tính trạng
Ashikari et al (1) lựa chọn hai bố mẹ là hai như là lúa khác biệt về năng suất, một kiểu như thuộc chiếc lúa ôn đới japonica bao gồm năng suất không đảm bảo nhưng quality tốt, tạo ra loại gạo Koshihikari (gạo được sử dụng trong sushi) cùng một tương tự lúa nhiệt đới indica bao gồm năng suất cao hơn nhưng chất lượng không cao bằng, tạo nên loại gạo Habataki. Điểm cần chú ý ở đấy là ngoài việc những tác giả chọn hai giống gồm năng suất không giống nhau nhưng cũng đồng thời gồm sự khác biệt về xuất phát và khu vực phân tía nhất định (japonica với indica) để có tương đối nhiều đa hình về trình từ bỏ DNA thân hai ba mẹ, tạo thuận tiện cho thi công marker phân tử mang đến phân tích sau này.Thêm vào đó, hai giống bố mẹ được chọn là các giống lúa yêu thương phẩm nên công dụng nghiên cứu rất có thể áp dụng mang đến sản xuất dễ dãi hơn.
Song song với năng suất (cụ thể là số lượng hạt trên bông lúa cùng số bông trên cây), những tác giả cũng nghiên cứu và phân tích một tính trạng nữa là chiều cao cây do hai giống bố mẹ có độ cao cây không giống nhau. Trong lịch sử chọn tương tự lúa, như là thấp cây IR8 (Viện nghiên cứu và phân tích lúa trái đất (IRRI)) góp cây đứng thẳng, không biến thành nghiêng đổ. Đặc đặc điểm đó giúp cây cải tiến và phát triển và quang quẻ hợp giỏi hơn lúc được chuyên bón tốt, giúp tăng năng suất cây trồng. Tương tự thấp cây này có thể coi là đại lý cho “cuộc cách mạng xanh” sinh hoạt châu Á trong thời hạn 60 của cố gắng kỉ 20.
Từ hai giống cha mẹ trên, việc tiếp theo là tạo ra các quần thể phân li tự hai bố mẹ. Quần thể phân li có thể ở ráng hệ F2 hay ráng hệ lai trở lại. Ở đây Ashikari et al (1) đã tạo thành một quần thể khá quan trọng đặc biệt để bước đầu nghiên cứu là quần thể backcross inbred lines (BIL)- lai quay lại cận giao tái tổ hợp. Quần thể này được chế tạo ra ra bằng cách thế hệ F1 được lai quay trở lại với một trong những hai bố mẹ, ở đấy là giống japonica Koshihikari, thay vì tự thụ phấn. Tiếp nối sử dụng phương thức một hạt một nắm hệ (single seed descent) để chọn ra những dòng ở những thế hệ tiếp theo, đến nắm hệ F7 khi gần như là hệ gene của các dòng vẫn ở trạng thái đồng hòa hợp tử. Vị sao tác giả lại tạo nên quần thể này? Như đang đề cập làm việc trên, tính trạng năng suất có tác động lớn từ bỏ môi trường, với tính trạng này thường xuyên được xác định thông qua quý giá trung bình bên trên nhiều thành viên chứ không phải một cá thể. Việc tạo ra các chiếc đồng đúng theo tử bởi vậy giúp họ hoàn toàn có thể lặp lại được việc đo năng suất ở nỗ lực hệ tiếp theo (trồng những cây hơn) để sở hữu được số liệu an toàn và đáng tin cậy về năng suất mà lại vẫn giữ nguyên được mẫu mã gene của cây đề nghị đánh giá. Quy trình tạo ra những dòng BIL này cũng góp họ sản xuất được các dòng ngay sát đẳng gene (nearly isogenic lines) để thuận tiện cho câu hỏi cô lập đúng chuẩn gene sau này. Hơn thế nữa nữa, do đó là các loại đồng hợp tử nên có thể trồng để nghiên cứu nhiều phong cách hình khác nhau nhưng chỉ cần xác định thứ hạng gene một lần, thuận tiện cho vấn đề hợp tác phân tích về sau.
Các tác giả sử dụng 96 cái BIL để thực hiện phân tích QTL. Yêu thương cầu tiếp theo là phải đã đạt được một bộ những marker phân tử bên trên toàn hệ gene và lập bản đồ liên kết những marker đó trên quần thể vẫn phân tích.Việc lập bản đồ liên kết về bản chất là dựa trên hiện tượng phân li, links gene cùng tái tổng hợp ở quần thể phân li đang phân tích để xác định vị trí những marker bên trên nhiễm sắc đẹp thể. đầu tiên ta cần phải có các marker phân tử, biểu hiện sự đa hình về trình từ DNA giữa hai hệ gene bố và mẹ. Những đa hình DNA thường được sử dụng cho phân tích bạn dạng đồ gen gồm: 1) Sai khác về một nucleotide (Single Nucleotide Polymorphisms – SNPs), 2) Đa hình bởi mất hoặc chèn thêm nucleotide (deletion/insertion), 3) Đa hình do biến đổi số phiên bản sao của các trình tự lặp lại tiếp tục (như microsatellites...). Đây là mọi là những loại đa hình hoàn toàn có thể xác định được dựa trên cách thức PCR và cắt enzyme giới hạn thông dụng trong các phòng thí nghiệm. Như đã đề cập sống trên, hai cái lúa cha mẹ trong nghiên cứu và phân tích này nằm trong hai đội japonica và indica. Hai nhóm này có sự cách li trong lịch sử vẻ vang và nghiên cứu cho biết thêm có nhiều đa hình DNA.Thêm vào đó, trình từ bỏ lúa nhóm japonica đã được lời giải tại thời gian tiến hành nghiên cứu nên việc trở nên tân tiến bộ marker phân tử giữa hai đội giống này bên trên toàn hệ genome là điều hoàn toàn có thể làm được.
Ashikari et al (1) chọn phân tích 200 marker trải phần lớn trên 12 nhiễm sắc đẹp thể của lúa. Sau khi đã có các marker và xác minh được hình trạng gene của từng cây vào quần thể phân tích, bọn họ dùng các công cụ giám sát và đo lường để hoàn toàn có thể lập nhóm links và tính khoảng cách di truyền giữa các marker. Về cơ bản, quá trình này gồm hai phép tính: 1) khẳng định sự phân li tự do hay sự liên kết giữa 2 marker, 2) nếu bao gồm sự liên kết thì xác minh trật tự và khoảng cách của những marker dựa vào tần số thảo luận chéo. Với con số marker lớn lên tới hàng trăm, thậm chí hàng ngàn việc tính toán bằng tay thủ công là không thể. Hiện thời có đa số mềm giúp ta việc thống kê giám sát này, rất có thể kể đến các chương trình thông dụng như Mapmaker, Joinmap giỏi R/qtl.
Sau lúc đã xác định được hình dáng gene của từng thành viên trong quần thể phân tích và lập được bản đồ ren liên kết, việc tiếp sau là xác minh giá trị thứ hạng hình tính trạng phân tích trên từng cá thể. Khi đã tất cả số liệu dạng hình gene và kiểu hình, câu hỏi đặt ra bây giờ là liệu tất cả sự tương quan giữa từng địa chỉ marker trên bản đồ với kiểu dáng hình tính trạng nghiên cứu. Đối với những quần thể phân li dựa trên việc lai 2 bố mẹ như trong bài xích báo đã phân tích thì, về phiên bản chất, kia là việc kiểm tra coi liệu tất cả sự sai không giống một giải pháp có ý nghĩa sâu sắc thống kê về hình dạng hình của những cá thể với allele từ bố so với những cá thể mang allele từ mẹ tại một vị trí marker nhất định (Hình 1). Bao gồm nhiều phương pháp để kiểm tra câu hỏi này nhưng phương pháp cơ bạn dạng nhất là kiểm tra bằng phép toán t-student hoặc so sánh phương sai (ANOVA).
Trên thực tế phương pháp phân tích QTL thông dụng được dùng là phương pháp interval mapping (dò tìm theo đoạn) (2), cầu lượng vị trí QTL thân hai marker và áp dụng phép thống kê lại là cực hiếm ODDs (viết dưới dạng logarithm of ODDs - LOD). Giá trị ODDs là tỉ số giữa phần trăm sự kiện 1 (H1) trên tỷ lệ sự kiện 2 (H2). Ví dụ: Ta thâm nhập vào trò chơi tung đồng xu cùng đặt cược sự lộ diện mặt sấp, người chủ trò tung 10 lần thường xuyên nhưng những là khía cạnh ngửa! Liệu tất cả sự gian lậu ở đây? tỷ lệ để một “đồng xu” gồm hai mặt mọi là phương diện ngửa (người nhà trò vẫn gian lận) tung 10 lần liên tục là khía cạnh ngửa (H1) là (1)10=1. Xác suất để một đồng xu có hai mặt (sấp và ngửa, có nghĩa là đồng xu thật) tung 10 lần liên tiếp là mặt ngửa (H2) là (0.5)10 = 10-3. Quý hiếm ODDs tại chỗ này sẽ là H1/H2 = 1000 với LOD là 3, tức là khả năng người chủ trò sử dụng đồng xu bao gồm hai mặt gần như là phương diện ngửa (gian lận) cao hơn nữa gấp 1000 lần kĩ năng sử dụng đồng xu có hai phương diện sấp với ngửa (đồng xu thật).
Một điểm cần chăm chú trong so với QTL đó là con số các phép đánh giá như trên. Trong những phép thử, nếu ngưỡng tin yêu được lựa chọn là giá trị phường ≤ 5% để tóm lại có sự sai không giống có ý nghĩa sâu sắc thống kê thì bởi nhiều marker được thực hiện nên sẽ có không ít phép thử cùng lúc đó tỷ lệ để 1 phép test ngẫu nhiên có mức giá trị p ≤ 5% là rất to lớn (dương tính giả - false positive). Vì chưng đó cần phải dùng các kỹ thuật những thống kê hiệu chỉnh, lấy một ví dụ như phương thức Bonferonni, Benjamini – Hochberg FDR tuyệt hoán vị (permutation) để lựa chọn một ngưỡng giá bán trị phường thích hợp.Trong đối chiếu QTL bằng phương thức interval mapping, thường xuyên thì với giá trị LOD từ 3 trở lên, tài năng tại địa điểm QTL đó có liên quan đến tính trạng cần ân cần là cao (Hình 2).
Các tác giả xác minh được 5 QTL cho số lượng hạt bên trên bông với 4 QTL cho chiều cao cây. Đối với tính trạng số lượng hạt trên bông, quý giá LOD xấp xỉ từ 1.5-9. Một giá trị nữa trong so sánh QTL cần được để ý là cực hiếm R2 giỏi PVE (Phenotypic variance explained - phần trăm lý giải sự biệt lập kiểu hình tại vị trí QTL đó). Quý giá này rất có thể tính tự phép phân tích phương không nên ANOVA nhắc ở trên. Không không thể tinh được khi QTL Gn1 có giá trị LOD =9 cũng đều có giá trị R2 cao nhất: 44%. Cả hai quý giá LOD với R2 mang đến QTL này là rất lớn, có thể dễ dàng rành mạch được các nhóm dạng hình hình khác nhau (QTL này làm cho tăng số lượng hạt tới 92 hạt). Bởi vì đó, phần trăm có gene trong vùng QTL này tác động đến tính trạng là rất cao (LOD = 9, kỹ năng có QTL cao hơn 109 lần so với kĩ năng không bao gồm QTL). Đối cùng với tính trạng chiều cao cây, các tác mang cũng xác minh được một QTL mập là Ph1 (LOD = 6.5, R2 = 30%). QTL này bên trong vùng ren “cách mạng xanh” semi-dwarf1 đã làm được phân lập và giải trình từ bỏ (4). Đọc trình tự mang lại thấy đúng là Habataki, kiểu như được chọn làm ba trong phép lai này, gồm đột bặt tăm đoạn ở ren này. Tác dụng này rất có thể coi như tiêu chuẩn chỉnh so sánh cho thấy thí nghiệm QTL ở đó là chính xác. Có một điểm thú vui là tương tự Koshihikari với cây cao và con số hạt thấp hơn nhưng có một QTL tăng độ cao cây cùng 3 QTL giảm chiều cao, 4 QTL tăng con số hạt trên bông cùng 2 QTL giảm con số hạt. Hoàn toàn có thể thấy số QTL làm tăng hay bớt tính trạng hình dạng hình ko phản ánh hình dáng hình tính trạng sau cuối của cá thể. Trên thực tế, những QTL sẽ shop với nhau để tạo nên tính trạng.
Như vậy từ toàn bộ hệ genome cùng với 12 nhiễm sắc thể, bởi kĩ thuật QTL mapping, các tác trả đã khu vực các vị trí có thể có liên quan đến tính trạng cần nghiên cứu. Để liên tục tìm ra chính xác gene ảnh hưởng, họ lựa chọn QTL có mức giá trị lớn số 1 để phân lập. Bước tiếp sau này call là fine mapping, xác đinh địa chỉ QTL đúng chuẩn đến rõ ràng từng gene. Để dễ dàng và tăng đúng mực cho quá trình tìm địa điểm gene ở độ phân giải cao, các tác giả phát triển dòng đẳng gen (nearly isogenic line -NIL) mang đến vị trí QTL đề nghị nghiên cứu bằng phương pháp lai lại những lần với 1 trong những hai bố mẹ và thực hiện marker phân tử để lựa chọn lọc. Những dòng ngay gần đẳng ren này giúp chế tạo sự đồng bộ cho quần thể phân li, giảm hiện tượng tương tác gene ảnh hưởng đến việc đo đạc kiểu hình (Mendel hóa tính trạng số lượng). Các dòng này được sử dụng làm phụ huynh để tạo new một quần thể F2. So với nhanh bằng phương pháp sử dụng 96 cây F2 từ loại đẳng ren NIL-Gn1 các tác giả khẳng định được trên thực tiễn có tới 2 QTL Gn1a và Gn1b ở vùng này. QTL Gn1a được xác định đúng mực nằm trong tầm 2 marker R3192 cùng C12072S, cho nên vì thế được chọn để tách bóc dòng. Ko kể ra, vùng Gn1a này cũng đã khẳng định được phiên bản đồ thiết bị lí với những dòng BAC chứa tổng thể vùng tất cả 2 marker sinh hoạt trên (hình 2G trong
Ashikari et al (1)). Với việc trình tự hệ gen lúa đang được giải thuật cộng cùng với xác định đúng đắn khoảng cách vật lí thân 2 marker góp việc xác minh gene trở nên tiện lợi hơn vì rất có thể thiết kế được rất nhiều marker và biết được trật từ của chúng trong vùng bắt buộc phân tích. Bài toán hôm nay sẽ là áp dụng một quần thể phân li lớn với khá nhiều marker vào vùng đối chiếu để xác định các thành viên có dàn xếp chéo, so sánh với phong cách hình để từ từ thu nhỏ độ bự vùng cần tìm kiếm. Ở đây các tác giả sử dụng tới hơn 13000 cây F2, tuy vậy cũng cần chăm chú là các tác mang không cần xác minh kiểu hình trên toàn cục 13000 cây cơ mà chỉ trên những cây có hiện tượng trao thay đổi chéo. Lúc độ mập của vùng tìm kiếm kiếm càng nhỏ, tỉ lệ trao đổi chéo cánh sẽ siêu thấp và cần nhiều cá thể để sở hữu xác suất đưa ra cây bao gồm trao đổi chéo cánh trong vùng bé dại đó (1c
M tương tự với tỉ lệ thành phần 1% trao đổi chéo cánh ở giao tử và 1c
M đôi khi vẫn là một trong vùng lớn hoàn toàn có thể chứa tới vài chục gene). Các tác giả đang thu khiêm tốn được vùng có thể liên quan cho tính trạng cùng với độ lớn chỉ là 6.3 kb cùng chỉ có 1 gene trong khoảng này, gene cytokinin oxidase Os
CKX2. Hình 3 bắt lược công việc cơ phiên bản trong khẳng định và bóc tách dòng QTL.
Liệu đã kết luận được là gen này tác động đến tính trạng? Để minh chứng điều này yên cầu các tác giả cần tìm kiếm thêm những allele của ren này và so sánh tính trạng giữa chúng. Nếu hoàn toàn có thể các người sáng tác cũng cần tạo ra các cây gửi gene làm tăng xuất xắc giảm biểu thị của gene này giúp xem có chuyển đổi tương ứng về phong cách hình giỏi không. Ashikari et al (1) đã triển khai tìm thêm những giống có các allele không giống nhau, đôi khi cũng chế tác cây gửi gene và diễn đạt rõ rằng bài toán tăng tốt giảm biểu lộ của gen Os
CKX2 tác động đến số lượng hạt. Các hiệu quả này đã minh chứng được sự biệt lập về biểu hiện của gen này chính là thực chất di truyền của QTL đang nghiên cứu. Những tác trả cũng tiến hành thêm 1 bước nữa là áp dụng gene này mang lại chọn giống, phối hợp cả cùng với allele làm thấp cây và đã cho biết thêm việc áp dụng vùng nhiễm nhan sắc thể đựng locus Gn1 có tác dụng tăng con số hạt trên cây cho tới 30%. Tất cả một điểm cần để ý ở đấy là ở locus Gn1, dạng allele mang đến năng suất cao bắt đầu từ dòng indica, và có thể chỉ có ích khi chuyển vào dòng xoáy japonica. Vì đó đối với các nước trồng lúa indica như việt nam việc áp dụng QTL này rất có thể sẽ đang có ít lợi ích.
Kết luận
Tóm lại đó là một nghiên cứu hoàn hảo về xác minh gene cho một tính trạng cạnh tranh là năng suất lúa.Với việc kiến thiết thí nghiệm đúng chuẩn và thực hiện các phương thức nghiên cứu cẩn thận, công phu đã giúp nhóm phân tích thành công. Bài bác báo đã tùy chỉnh thiết lập một tiêu chuẩn cao nhằm các nghiên cứu về di truyền tính trạng con số hướng tới.
Đối với Việt Nam, nước ta có tương đối nhiều giống cây cỏ quý đặc hữu có những tính trạng nông học và unique cao. Câu hỏi phân lập gene dựa vào các cách thức di truyền cùng sinh học tập phân tử như ở đây không những nâng cấp hiểu biết về các quy trình sinh học ở sinh vật mà còn góp sức trực tiếp cho việc chọn tạo thành giống cây trồng có định hướng một cách bao gồm xác. Các văn minh kỹ thuật hiện thời đã giúp áp dụng chính sách ưu đãi giảm giá thành việc xác minh kiểu gene các lần và là 1 trong lợi thế bọn họ cần ráng bắt. Việc đặc biệt nhất vẫn đã là bảo tồn các nguồn gene quý trong các trung tâm giống cây cỏ quốc gia, và thiết kế các thí nghiệm nhằm lai tạo những quần thể và khảo sát điều tra kiểu hình, tìm thấy gene hay thông tư phân tử bổ ích để vận dụng vào sản xuất.
Tài liệu tham khảo:
Ashikari M, et al. (2005) Cytokinin oxidase regulates rice grain production. Science 309(5735):741-745.
Lander ES & Botstein D (1989) Mapping Mendelian factors underlying quantitative traits using RFLPlinkage maps. Genetics 121(1):185-199.
Yano M, et al. (1997) Identification of quantitative trait loci controlling heading date in rice using a high-density linkage map. Theoretical & Applied Genetics 95(7):1025-1032.
Sasaki A, et al. (2002) Green revolution: a mutant gibberellin-synthesis gene in rice. Nature 416(6882):701-702.
Đọc thêm
Tanksley SD (1993) Mapping polygenes. Annual đánh giá of Genetics 27:205-233.
Yano M (2001) Genetic & molecular dissection of naturally occurring variation. Current Opinion in Plant Biology 4(2):130-135.
Xem thêm: Cách sử dụng điều hòa tiết kiệm điện nhất mùa nắng nóng, 5 mẹo tiết kiệm điện dùng điều hòa mùa nắng nóng
Lời cảm ơn: người sáng tác xin cảm ơn Quỹ Giáo dục việt nam VEF đã tài trợ một phần cho phân tích này
Về tác giả: T.S. Nguyễn Viết Cường thừa nhận bằng tiến sỹ về di truyền thực trang bị tại đại học Cornell, New York, Hoa Kỳ năm 2014. Tác giả nghiên cứu và phân tích về di truyền cà chua, ví dụ là kiếm tìm ra những gene tác động đến thừa trình cải tiến và phát triển và chín quả và những gene làm cho tăng quality và giá trị dinh dưỡng ở cà chua.